Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp1Q00915 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp1Q00915 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms