Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb4P99026 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms