Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp1P98063 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp1P98063 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp1P98063 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp1P98063 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp1P98063 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bmp1P98063 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bmp1P98063 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bmp1P98063 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bmp1P98063 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bmp1P98063 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bmp1P98063 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bmp1P98063 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bmp1P98063 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bmp1P98063 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bmp1P98063 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bmp1P98063 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp1P98063 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms