Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NficP70255 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NficP70255 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NficP70255 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NficP70255 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NficP70255 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NficP70255 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NficP70255 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NficP70255 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NficP70255 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NficP70255 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms