Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc9P70170 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Abcc9P70170 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Abcc9P70170 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Abcc9P70170 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc9P70170 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms