Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg2P63268 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg2P63268 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg2P63268 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg2P63268 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms