Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SnrpfP62307 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnrpfP62307 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnrpfP62307 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms