Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnd3P61588 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnd3P61588 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms