Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VdrP48281 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VdrP48281 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VdrP48281 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VdrP48281 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VdrP48281 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VdrP48281 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VdrP48281 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VdrP48281 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VdrP48281 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VdrP48281 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VdrP48281 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VdrP48281 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VdrP48281 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VdrP48281 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VdrP48281 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
VdrP48281 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VdrP48281 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VdrP48281 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms