Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sftpa1P35242 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sftpa1P35242 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms