Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcdP28867 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcdP28867 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcdP28867 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms