Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Etv4P28322 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Etv4P28322 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Etv4P28322 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Etv4P28322 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms