Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfyaP23708 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NfyaP23708 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms