Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Dnmt1P13864 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Dnmt1P13864 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Dnmt1P13864 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms