Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl2P10148 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms