Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dll3O88516 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dll3O88516 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dll3O88516 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms