Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme6O88425 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme6O88425 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme6O88425 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme6O88425 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms