Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx3O70492 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx3O70492 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx3O70492 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx3O70492 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx3O70492 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms