Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxq1O70220 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxq1O70220 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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