Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt5hO55201 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms