Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf12O54907 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf12O54907 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms