Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20939L7N243 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms