Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc191J3QQ27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc191J3QQ27 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms