Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
D430041D05RikF6ZGR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
D430041D05RikF6ZGR6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms