Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.79■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Crocc2F6XLV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Crocc2F6XLV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Crocc2F6XLV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms