Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chd2E9PZM4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chd2E9PZM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd2E9PZM4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms