Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Piezo1E2JF22 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Piezo1E2JF22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Piezo1E2JF22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms