Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms