Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cttnbp2B9EJA2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cttnbp2B9EJA2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cttnbp2B9EJA2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms