Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AU015836B2RUM3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AU015836B2RUM3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms