Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Plekhd1B2RPU2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Plekhd1B2RPU2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plekhd1B2RPU2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms