Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Uhrf1bp1B2KF50 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms