Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NhsB1AV60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NhsB1AV60 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NhsB1AV60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NhsB1AV60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms