Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc183A2AJB1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc183A2AJB1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms