Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramel3A2AHA7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramel3A2AHA7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms