Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms