Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms