Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms