Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcniQ9Z2V9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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