Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn8Q9Z260 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn8Q9Z260 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn8Q9Z260 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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