Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms