Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms