Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PplQ9R269 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms