Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col4a3Q9QZS0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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