Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms