Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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