Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FancaQ9JL70 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms