Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms