Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usp12Q9D9M2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usp12Q9D9M2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp12Q9D9M2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp12Q9D9M2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usp12Q9D9M2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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