Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Nop56Q9D6Z1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Nop56Q9D6Z1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Nop56Q9D6Z1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Nop56Q9D6Z1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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